电子转移挑战通用荧光技术
色氨酸是一种氨基酸,也是蛋白质的基石之一。它被广泛用于研究蛋白质如何改变自己的3D结构,以及如何与其他蛋白质和分子发生相互作用,通常采用的研究方法是FRET—一种测量能量从色氨酸传递到其他分子的荧光技术。但是在某些情况下,FRET获得的数据不一定可靠,因为色氨酸传递的是电子而不是能量。EPFL的科学家采用了一种独特的光谱技术可用于这种情况。该研究结论发表在《PNAS》上。
FRET经常和色氨酸一起使用,因为色氨酸具有作为本征荧光的优势。对于FRET,被研究的蛋白质经过修饰后在适当的位置具有受体分子。当蛋白质改变其3D结构时,色氨酸和受体分子相互接触,从而传递能量。这会导致色氨酸荧光的减弱,从而可以得出色氨酸和受体分子之间的距离。因为蛋白质的结构已经确定,因此FRET可以告诉我们关于其变化的诸多信息。
但是也存在许多问题。EPFLMajedChergui实验室的研究表明,当蛋白质内色氨酸电子发声转移时,FRET会发生偏斜。该研究工作是建立在2013年《自然》上一篇关于铁肌红蛋白的研究工作基础上的。在那篇研究中,Chergui团队的研究表明,肌红蛋白中的色氨酸能自然地将电子转移到蛋白质的氧结合分子中。因为电子转移也会引起色氨酸荧光的衰退,这可能被误认为是一个积极的信号,也会提出这样的问题—这在其他蛋白质中是否也存在这样的情况。
在该研究中,Chergui课题组致力于研究与生物学更相关的类血红素蛋白—亚铁肌红蛋白。科学家们研究了他们的生理状态,观察色氨酸是否会将电子转移到血红素分子中。然而,他们必须在非常短的时间条件下工作。为了克服这样的障碍,科学家开发了一种全新的光谱工具—超高速紫外二维光谱法。
该研究表明,事实上电子转移发生在色氨酸和血红素分子之间。此外,他们的研究表明色氨酸的电子转移比之前预测的更频繁,因此, FRET研究中采用的色氨酸荧光会受到质疑。“这项发现确实会为基于FRET分析的研究带来问题,”MajedChergui说。“如果色氨酸在测试的蛋白质中转移电子,那么这可能会被误认为蛋白质的构型变化发生错误。”
新材料在线编译整理——翻译:杨超 校正:摩天轮
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